第三十一集
　　康熙称不让宝日龙梅留在身边是不想为任何人利用，但他一定会剿灭葛尔丹，并恩施宝日龙梅留在苏麻喇姑身边。胤禔万分沮丧。蓝齐儿送李光地赴闽就任，又与葛尔丹相遇。葛尔丹把在京城所购丝绸等物全部烧毁，发誓重建元大都。胤礽在索府喜欢上了收留的孤女红玉。朝政之上，胤礽提出立即收复台湾，群臣附议。康熙封索额图为钦差大臣，前往福建督战。索额图来到福建，姚启圣、施琅、李光地均表示反对立即攻台，认为目前各方面条件并不成熟，但索额图力主战事，并以康熙相压，姚启圣对索额图称，明日一早相报最后决定。姚启圣仔细分析索额图意图，决定给康熙上折。姚启圣与李光地、施琅三人联合上奏皇帝，请求暂缓攻台，索额图也给康熙上奏请战，康熙经过再三权衡，下旨攻台。驻闽旗兵强暴民女致死，姚启圣向索额图告状，索额图却不以为然，但恐民变，索额图只好向民众保证严惩肇事者。旗兵开始出师攻台。
第三十二集
　　水师全军挫败，但施琅得胜归来。康熙下旨索额图回京。姚启圣上奏请罚，康熙准其回家丁忧。姚启圣离职之前，给康熙上了一折，称攻台之前曾给康熙上过三折，康熙并未收到，大为震怒，下旨彻底清查，兵部经办官员引咎自尽，保护了幕后主子。慧妃向康熙称赞胤禔。康熙病中召胤禔来见，胤禔称兵部压制姚启圣三封奏折，乃是有意而为，目的是为了保护索额图，并说上次胤礽在朝政上率先提出力主攻台，也是索额图的旨意。康熙斥责容妃推荐慧妃担任后宫主持。容妃向孝庄皇太后哭诉，孝庄皇太后前去看望康熙，康熙自觉胤礽是被人利用的，朋党相争初露端倪，孝庄称可以利用明珠与索额图的党争。郑经来函要求谈判，康熙令他们来大陆谈判，并命明珠前往谈判。康熙与容妃谈论蓝齐儿与李光地的婚事，均表赞同。明珠与郑经使者冯西范谈判，称是招抚。

第三十三集
　　明珠与郑经使者冯西范讨价还价，初步达成招抚条件，但最后冯西范提出郑经要三年以后才能登岸，得寸进尺，康熙下旨向郑经开战。姚启圣重被启用。姚启圣、施琅、李光地三人联名向康熙立下收台军令状。郑经巡视海防，进行部署安排。旗兵为了军备，又抢民财，与汉兵水师发生纠纷。姚启圣上奏康熙要求旗兵离闽，葛尔丹又兵犯蒙古各族，军力大增。康熙请明珠和索额图主持庭仪，康熙病恙回去休息。事后，明珠和索额图前来报告庭仪情况。李光地给康熙上密折，陈请旗兵离闽与否各种准备，康熙决定旗兵撤闽。葛尔丹使者来京晋见康熙，称葛尔丹向蓝齐儿求婚，康熙大怒不准，葛尔丹使者加以威胁。康熙思量再三，只好让蓝齐儿下嫁葛尔丹。蓝齐儿刚刚接到李光地来信，欣喜万分，康熙和容妃告诉她葛尔丹一事，蓝齐儿如雷轰顶。

第三十四集
　　蓝齐儿向孝庄皇太后哭诉，孝庄讲诉自己经历，称女人为了大清国必须做出牺牲。蓝齐儿说父皇一定会在今后消灭葛尔丹，她该如何对待。孝庄称女儿唯独不能有自己。姚启圣与施琅在具体攻台策略上发生矛盾，双方上折康熙，康熙下旨命施琅专权主持平台事务，姚启圣免职回家继续丁忧。康熙下旨给魏东亭，近日将出巡南京，就近督促平台战事，并核实三千万两饷银是否筹齐。魏东亭喜中有忧。江苏道台葛礼怀疑南京栖霞寺的应空和尚就是杨起隆，向他敲诈八百万两银子，杨起隆无奈只好同意。葛礼到京迎驾，康熙叫他先回南京，协助魏东亭处理军饷事务。葛礼夜到索府，索额图叫他收下葛礼说的那四百万两银子，然后两人平分。南京丢失三门大炮，魏东亭到处寻找无着。杨起隆企图利用三门大炮炮轰康熙。蓝齐儿含泪离开京城，远嫁葛尔丹，胤禔护送。

第三十五集
　　康熙出巡南京，途中接到福建来报，请求攻台时间推迟一日，康熙下旨必须按原定日期收台。姚启圣称这是康熙为了重阳节那一天在明孝陵宣布平台，以便收服大明遗民之心。施琅出师攻台，群情振奋，姚启圣也要上船助战，施琅不允，说他不懂海事。姚启圣称他为了收台，祖坟都让人家挖了。施琅叫姚启圣拿出康熙密旨。姚启圣上船以后，施琅起锚出击。康熙在南京受到出击报告，甚为喜悦。康熙问魏东亭军饷筹备情况，魏东亭说尚不足，拟将家资也充入，康熙给他出了不少筹饷主意。魏东亭下令严搜紫金山和栖霞山，寻找三门大炮。葛礼向杨起隆索要八百万两银子。杨起隆准备好三门大炮。郑经受到澎湖水师战败，马上前去督战。双方展开激战，郑经兵败自尽。康熙下旨不准施琅上岸，以防他报复，但姚启圣还是陪施琅在海岸边祭奠被郑经杀害的施琅的亲人。康熙在明孝陵收到台湾收复快报，对朱元璋坟墓自语大清远胜于大明。

第三十六集
　　葛礼亲自率兵到栖霞寺找寻银两，三门大炮也找到，魏东亭称也将栖霞寺银两作军饷，但杨起隆逃逸了。康熙因魏东亭渎职进行处罚，给他两条出路，魏东亭选择了去台澎当知县。康熙恩赏姚启圣、施琅、李光地三人并对李光地称对他期望很大。葛尔丹接走蓝齐儿，蓝齐儿向胤禔反射一箭，称她已是葛尔丹的女人。葛尔丹继续扩张，并暗中得到沙俄支持，严重威胁大清皇权。葛尔丹东迁，逼近内地。葛尔丹和蓝齐儿有了孩子以后，恩爱和睦，葛尔丹专门为蓝齐儿建造了一座仿照北京的宫廷让她居住。蓝齐儿问葛尔丹东迁是否是为了攻打北京，葛尔丹明白无误称是。康熙立胤礽为储君之尊，胤禔内心有所不快，并向康熙禀报葛尔丹侵犯嘉峪关长城。康熙巡视长城，称长城乃是摆设，停建城墙关隘，而应取民心练兵马，永不驻长城，并命侍读张延玉以五品任知县。康熙在长城检阅御林军。康熙下旨安抚葛尔丹、达赖和蒙古各族首领，料葛尔丹必拒，以孤立葛尔丹。索额图以李光地以前的风流孽债要挟李光地，李光地骇然。

第三十七集
　　索额图揭穿家中蔡总管卧底身份，蔡总管自尽。在官吏任用上，明珠也向李光地拉拢施压。李光地往访苏麻喇姑，倾诉心中苦恼，称本想做一个博学鸿儒，不料陷入了官场，而且左右夹缝，险象迭生，并称他的老师是伍次友，勾起苏麻喇姑无限感情。李光地告诉苏麻喇姑，伍次友已于八年前离世。在官吏任用名单上索额图和明珠继续向李光地施压，并互相攻击对方结党营私，绝没有好下场，请李光地站稳立场。李光地左右为难。康熙召见被葛尔丹驱出家园的蒙古各族首领，称打败葛尔丹后，原来的一切都将重新归还他们，并以亲王之待遇让他们居京，所用军饷以后归还。李光地向康熙请辞为民，并当场揭穿索额图。明珠的朋党之争，被康熙免职押入大牢。苏麻喇姑在康熙面前为李光地说情。康熙向宝日龙梅称要亲征剿灭葛尔丹，并请苏麻喇姑去牢里看望李光地。李光地在牢里欲自尽，苏麻喇姑劝其不能自尽，自尽则是畏罪，而活着就有希望。慧妃在容妃面前贬低胤礽。康熙告诉容妃蓝齐儿已有二岁孩子，并称已给葛尔丹这个女婿准备好了十万铁骑的礼物，准备进行剿灭。康熙宣誓亲征削灭葛尔丹。

第三十八集
　　葛尔丹将康熙的圣旨和所赐礼物付之一炬。康熙亲征率军征讨，宝日龙梅也要参战，康熙阻止，下旨宝日龙梅不准离开京城。康熙带李光地坐着囚车出征，李光地自称糊涂之人。胤礽留京主政，浸于荒淫，让众臣跪在朝前，索额图提醒胤礽要善于笼络众臣之心，以备将来之用，并提供了明珠营私之材料。胤禔称首战告捷，但康熙认为葛尔丹避开主锋，定是另有所谋。康熙在营地见李光地，对其劝勉有加，复职侍驾。康熙身体不适，染上寒热重症，京城议论纷纷。索额图在胤礽面前称康熙也许已经龙体归天，并称应该严密控制京城，以备及时登基。容妃向孝庄皇太后告别，前往漠北探望康熙。慧妃向孝庄皇太后禀报宫内太子急于要当皇上。孝庄皇太后在众臣面前辟谣，索额图宣布京城戒严。康熙在营地病情日沉。蓝齐儿惦念葛尔丹，来到战地探望，并劝葛尔丹退兵，葛尔丹称一定要血战到底。

第三十九集
　　葛尔丹兵分两路朝康熙大营逼近。康熙自觉可能无法回到京城，留下遗诏，欲立胤礽接位，明珠极力劝阻，称胤礽在京散布谣言，欲想登基。康熙急火攻心，病情更重。容妃带着两个在路上遇到的几个法国牧师来到康熙军营，法国牧师带来最新研究成功的治理寒热西药，容妃试服以后无碍。葛尔丹与胤禔兵刃对阵，蓝齐儿冲入劝止。康熙服药以后，病情好转。康熙下旨开战，容妃冲入战场，与蓝齐儿抱在一起，双方展开血战，死伤无数。李光地传康熙圣旨，令容妃和蓝齐儿回到康熙大营，蓝齐儿不从，坚回葛尔丹身边。康熙病初愈，担心宫廷有变，准备班师回京。康熙降容贵妃为妃。胤禔孤军追击，被葛尔丹抓获。蓝齐儿回到葛尔丹营地，蓝齐儿劝葛尔丹不要再战了，葛尔丹称不久与康熙之间还有一场更大的激战。明珠率兵到处寻找胤禔。蓝齐儿与胤禔相见，胤禔称提前放箭是为了不让她被射中，蓝齐儿欲放胤禔逃跑，葛尔丹看到，最后准行。胤禔在途中遇到找他的明珠，明珠告诉他在康熙面前不能提被捕一事。

第四十集
　　胤禔在康熙面前称自己过河激战之后，被大水冲走。康熙称这次亲征大挫葛尔丹，将来仍要御驾亲征。索额图告诉胤礽，称康熙班师回京，可能要使你我陷入险境，全是明珠、胤禔告的御状。索额图称要把提议做皇冠龙袍的管家交给康熙，以使胤礽脱离干系。康熙不愿见索额图等留京众臣。胤礽在康熙面前急于表白，康熙训斥。康熙和胤礽交心，胤礽称索额图留京期间力排谣言，稳定政局。李光地在苏麻喇姑面前称要积极入世，扳倒索额图和明珠两大朋党。康熙对宝日龙梅称，来年还要亲征剿灭葛尔丹，并拒绝了她想成为比嫔妃的要求。两位法国牧师前来为康熙侍驾，康熙让其随索额图赴尼布楚与沙俄谈判。明珠宣布索额图留京期间的官吏奖罚任用作废。李光地向康熙禀报明珠施政一事，康熙深感朋党相争之害，任用四名青年大臣入宫。索额图在边境收到京城密报，称一定要将谈判谈好，以在朝廷取得主动。

第四十一集
　　康熙整顿吏治，令大臣上奏弹劾违君之臣。康熙把弹劾明珠等朋党的奏章推到他门面前，恩威并施。康熙令李光地也上奏章，并令其对两封匿名弹劾索额图勾结朱三太子密谋炮轰康熙与胤禔曾被葛尔丹捕获的奏章进行查清。索额图《尼布楚条约》谈判成功，李光地烧掉了弹劾他的奏章。明珠六十大寿，众臣前来贺喜，李光地前来传达康熙圣旨，呈上康熙题词，并宣读自己弹劾明珠的奏章。康熙斥责索额图结党营私，并称因他《尼布楚条约》谈判成功才保他。明珠、胤禔冒雨跪地求见，康熙召明珠见驾，却仅说雨停可以回去了。胤禔向康熙坦白自己曾被葛尔丹俘虏过，是明珠叫他瞒骗的，康熙气得打胤禔耳光，并令他此事不能外传。张廷玉奉旨查抄明珠府。康熙向孝庄皇太后称明珠等朋党结党营私，自己也有责任。

第四十二集
　　康熙决定御驾亲征剿灭葛尔丹，容妃提出随营侍驾，孝庄皇太后认为宝日龙梅也应同去出征，并希望康熙能将蓝齐儿带回京城。张廷玉称明珠在牢里仍忙于公务，明珠称自己有错但无罪。康熙下旨明珠等大臣革职，永不录用，并称大清最大隐患在于朝廷，要求众臣遵循"正大光明"牌匾，把殿改为"正大光明殿"。康熙率军亲征，也把明珠放在囚车里带上，宝日龙梅亦随军出征。胤禔送食物给明珠，明珠不要，告诫胤禔心不能太软。太监偷看了弹劾索额图私通朱三太子的匿名奏折，向索额图与葛礼密报，索额图令葛礼押送粮食到漠北。索额图向胤礽称红玉可能乃是朱三太子的遗孤，并说胤礽储君之位岌芨可危，上策乃是提前登基，胤礽怒斥索额图。葛礼到漠北与逃到此处的朱三太子见面，叫朱三太子请葛尔丹偷袭自己掌管的清军粮草大营，康熙必败，并称朱三太子的遗孤丹丹正在索府，身怀龙子。葛尔丹偷袭粮草大营成功，康熙下旨节食，令索额图筹粮速运。明珠对李光地称，粮草大营被袭必有内奸。康熙令宝日龙梅召集旧部攻打葛尔丹。索额图接旨拖延运粮。

第四十三集
　　陈廷敬病逝。张廷玉运粮到漠北，向孝庄皇太后辞行。孝庄令他到苏麻喇姑处。苏麻喇姑给康熙写了一封信，称自己一生只真正爱过一个人，那就是弟弟玄烨。苏麻喇姑当着张廷玉的面，又将信烧掉。孝庄下旨给容妃，令容妃劝康熙不要废太子，对容妃称，等她走后，不许告诉康熙，并叫关上宫门。孝庄皇太后终于病故，苏麻喇姑也于当日圆寂。宝日龙梅给康熙带来了粮草和兵力，并探到了葛尔丹的营地，张廷玉也押粮运到。康熙部署兵力开战。捷报频传，康熙向张廷玉询问孝庄皇太后近况。胤禔与葛尔丹再次对阵开战。葛尔丹大军被剿灭。蓝齐儿和伤重的葛尔丹落荒而逃，胤禔追上，将葛尔丹斩杀。胤禔提着葛尔丹的首级，来见康熙。康熙与蓝齐儿相见，欲接蓝齐儿回京，并向蓝齐儿赔罪，封葛尔丹之子王位，但蓝齐儿不从没有回京。

第四十四集
　　葛礼劝说朱三太子密杀康熙。康熙在草原上举行庆贺胜利欢宴，并与宝日龙梅在草原上畅游，发生情爱，宝日龙梅回到蒙古旧部。朱三太子来袭康熙大营被歼，康熙见到被捕的朱三太子和战死的葛礼。康熙回京途中，索额图和胤礽着素服率众臣跪地迎驾，告孝庄皇太后和苏麻喇姑已经病逝，康熙昏厥过去。康熙来到灵堂。明珠在牢里捉虱子，咒骂政敌，索额图也被押进了大牢，明珠要张廷玉向康熙禀报由他来审办索额图一案，李光地建议胤礽赶快上奏折弹劾索额图，以与索额图划清界线，被胤礽扇了一个耳光。康熙下旨审理索额图一案，胤礽监审。索额图称葛礼袭营一事与他无关。李光地向康熙提议给索额图用刑，胤礽反对，康熙赞同胤礽。康熙下旨令明珠审理索额图，李光地、张廷玉、胤礽在屏后监审。明珠一件一件给索额图抖落罪状。康熙看完罪状，怒火中烧，并斥李光地不应审索额图弑君一事，下旨将明珠、索额图送回牢房颐养天年。

第四十五集
　　康熙问胤礽 索额图弑君一事，胤礽承认曾与他密商过，康熙称以后不会提起此事。康熙废除太子胤礽，胤礽当庭晕倒，容妃以孝庄皇太后之遗旨反对废太子，慧妃称孝庄皇太后不曾有此遗旨，康熙下旨将容妃押下，剥夺贵妃身份。红玉来见康熙，康熙下旨让红玉生下龙子以后再处置。容妃让红玉逃走。红玉来到朱三太子坟前跪祭，自杀身亡。胤禔来见佯疯的胤礽，奉旨问询。胤禔向康熙提议将胤礽杀了，康熙怒斥。康熙训导众皇子。李光地率兵进胤禔府，向胤禔宣旨将他软禁。康熙下旨给胤礽去掉枷锁，并予治病。康熙面对皇子争位，深感心力交瘁。康熙告诉容妃，红玉已自杀于朱三太子坟前，问容妃为何放逃红玉，容妃称康熙疑心太重，康熙拂袖而去，将容妃逐出后宫为奴。慧妃听到容妃被贬为奴大喜，令她去洗马桶。太监捉弄容妃。魏东亭请求因病告老，康熙准其回京，并赐王位，并令李光地去任台澎知县。李光地请求一辈子都做台澎知县，康熙恩准。蓝齐儿进京探亲，康熙称在她生日那天吃了一碗寿面。蓝齐儿问额娘容妃如何，康熙令她前来。容妃开始不从，后来着盛装前往。容妃和蓝齐儿母女相见。

第四十六集
　　容妃回去时，太监李德全送她孝庄皇太后生前用过的拐杖。蓝齐儿来到容妃处，并向康熙辞行，摔坏康熙所赠礼物。张廷玉前来向康熙禀报如何庆贺康熙登基六十年的中秋佳节。康熙称想热闹一下，张廷玉提议举办"千叟宴"。千叟宴上，索额图和明珠也戴枷前来，康熙见到魏东亭和他的孙子魏子玉。康熙挥酒祭天，敬众臣和百姓，再敬政敌，并称自己是历史上在位时间最长、子孙最多的一位皇帝。众皇子来给千叟敬酒。张廷玉也给索额图、明珠敬酒，索额图对明珠称相逢一笑泯恩仇。魏东亭称康熙"千古一帝"，康熙说只想把后事安排妥当。"千叟宴"外，容妃挑夜洗马桶，终被马桶压死。康熙赶来，下旨将在容妃身边的太监全部殉葬。容妃出殡路上，康熙对魏东亭称，在自己陵寝的西南也给他造了亲王等级的坟墓，并称容妃是他心头的一根刺，要带着它同赴黄泉。康熙在赫舍里棺前，谈论胤礽废了又立，立了又废，并在容妃遗体前封她为皇后。魏东亭对康熙称，想不到皇上会封这位皇子为接位之人，说完病逝。朝政之上，康熙即将宣布"立储"遗旨，却猝死在龙座上，走完自己辉煌的一生。